Эти логи включаются, если есть большие потери между публикующим WebRTC и сервером.
Какой кодек у вас выставлен в flashphoner.properties
codecs=opus,alaw,ulaw,g729,speex16,g722,mpeg4-generic,telephone-event,h264,vp8,flv,mpv
Если приоритет vp8,h264 то vp8 может отрабатывать лучше на потерях.